Las aproximadamente 1300 ha. de la reserva han sido afectadas por la actividad humana de manera disímil a lo largo del tiempo. Los sectores bajos, habitualmente cubiertos por el agua, prácticamente se han conservado sin grandes alteraciones. Los sectores más altos y planos han sido objeto de actividades de agricultura o pastoreo, por lo tanto conservan alteraciones propias de dichas actividades. Se distinguen tres ambientes:
Flora
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